Sono organi del FIMIAV il Comitato di Gestione e il Collegio Sindacale.
Il Comitato di Gestione del F.I.M.I.A.V. è composto da 12 componenti di
cui 6 in rappresentanza delle organizzazioni imprenditoriali agricole e 6 in rappresentanza
delle organizzazioni sindacali.
Il Presidente del Comitato di Gestione è il legale rappresentante del F.I.M.I.A.V.
Il Collegio Sindacale è composto da 3 membri di cui uno è presidente.